Prédire l'émergence de nouvelles communautés du microbiote intestinal humain

Prédire l'émergence de nouvelles communautés dans l'environnement stable du microbiote intestinal humain

Le microbiote intestinal humain peut montrer une certaine variabilité dans sa composition en microorganismes alors qu'il se trouve dans un environnement stable.

Un même environnement peut parfois abriter des communautés microbiennes très différentes. 

Un exemple bien connu est celui du microbiome intestinal humain. Un même environnement, comme l'intestin humain, peut donner naissance à des types de communautés distincts, (souvent regroupés en entérotypes). On ne sait toujours pas pourquoi une personne développe un type plutôt qu'un autre, et cela ne peut s'expliquer entièrement par la génétique, le pays d'origine ou l'alimentation.  

Pour expliquer ce phénomène au sein du microbiote humain, l'hypothèse proposée par les chercheurs INRAE de l'unité PROSE, était de faire des investigations du côté de la multistabilité. La multistabilité est un phénomène couramment observé dans les écosystèmes naturels, mais jamais, jusqu'à maintenant, démontrée de façon expérimentale dans le cas du microbiote intestinal humain. 

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Voir aussi

  • Garza, D.R., Liu, B., van de Velde, C. et al. Emergence of alternative states in a synthetic human gut microbial community. Nat Commun 17, 326 (2026). doi.org/10.1038/s41467-025-67036-5
  • Garza, D.R., Gonze, D. & Faust, K. Keystone concept revisited: insights into microbial community dynamics and control. Nat Rev Microbiol (2026). doi.org/10.1038/s41579-025-01266-8